РАЗЛИКА ИЗМЕЂУ СОЈА И ВАРИЈАНТЕ (Хвала Богу што је др Шеклер рекао да има око 16000 варијанти, али сигурно их има више)
Варијанта вируса је изолат чија се секвенца генома разликује од секвенце референтног вируса. Не закључује се да ли промена секвенце генома изазива било какву промену фенотипа вируса. Значење варијанте постало је замагљено у ери секвенцирања целог вирусног генома, јер скоро сваки изолат може имати мало другачију секвенцу генома. Такав је случај са САРС-ЦоВ-2: готово свака секвенца друге особе се мало разликује. До краја 2020. године, било која секвенца САРС-ЦоВ-2 било које две особе разликовала се за око десет нуклеотидних промена од 30.000. Све су варијанте, али термин се ретко користи у овом контексту. Међутим, од тада су идентификовани вирусни геноми са много више промена. Они су названи „варијантама забринутости“ (ВОЦ), јер се сматра да промене дају нова фенотипска својства као што је појачана способност. Британски научници учинили су добро назвавши их ВОЦ, јер их сада штампа мора називати варијантама.
Нажалост, мејнстрим медији, пратећи научнике који би заиста требало да знају боље, користе термин „сој“ да опишу оно што су заправо варијанте. Ова пракса се јавља код сваке вирусне епидемије: постоје нови, више (попуните празно с вашим омиљеним фенотипом) соја еболавируса, вируса Зика и сада САРС-ЦоВ-2. Почело је рано у 2020. години проналаском варијанти са једном аминокиселинском променом у протеину шиљка, од Д до Г на позицији 614.
Штампа је ово назвала новим сојем који је преносивији. Али употреба соја била је нетачна: то је варијанта и остаје до данас.
Сој вируса је варијанта која има јединствене и стабилне фенотипске карактеристике. Такве карактеристике могу се утврдити само резултатима експеримената рађених у лабораторији, у ћелијама у култури и на животињама, заједно са запажањима на зараженим људима. Име сој није лако добити: сигурно га новинари не могу једноставно дати! Као што је Јенс Кун написао, „Означавање варијанте вируса као соја била би одговорност међународних стручних група“.
Ниједна таква ознака соја није дата више пута за САРС-ЦоВ-2: постоји један и само један сој овог вируса. Ниједна нетачна употреба тог израза неће променити ову чињеницу. Као што можете претпоставити, међународној групи стручњака може бити потребно неко време да се договори о било чему.
Извор: Блог о вирусологији
https://www.virology.ws/2021/02/25/under...-and-more/